ATR (ген)

ATR (англ. ATR serine/threonine kinase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 644 амінокислот, а молекулярна маса — 301 367[5].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGEHGLELAS		MIPALRELGS		ATPEEYNTVV		QKPRQILCQF		IDRILTDVNV
VAVELVKKTD		SQPTSVMLLD		FIQHIMKSSP		LMFVNVSGSH		EAKGSCIEFS
NWIITRLLRI		AATPSCHLLH		KKICEVICSL		LFLFKSKSPA		IFGVLTKELL
QLFEDLVYLH		RRNVMGHAVE		WPVVMSRFLS		QLDEHMGYLQ		SAPLQLMSMQ
NLEFIEVTLL		MVLTRIIAIV		FFRRQELLLW		QIGCVLLEYG		SPKIKSLAIS
FLTELFQLGG		LPAQPASTFF		SSFLELLKHL		VEMDTDQLKL		YEEPLSKLIK
TLFPFEAEAY		RNIEPVYLNM		LLEKLCVMFE		DGVLMRLKSD		LLKAALCHLL
QYFLKFVPAG		YESALQVRKV		YVRNICKALL		DVLGIEVDAE		YLLGPLYAAL
KMESMEIIEE		IQCQTQQENL		SSNSDGISPK		RRRLSSSLNP		SKRAPKQTEE
IKHVDMNQKS		ILWSALKQKA		ESLQISLEYS		GLKNPVIEML		EGIAVVLQLT
ALCTVHCSHQ		NMNCRTFKDC		QHKSKKKPSV		VITWMSLDFY		TKVLKSCRSL
LESVQKLDLE		ATIDKVVKIY		DALIYMQVNS		SFEDHILEDL		CGMLSLPWIY
SHSDDGCLKL		TTFAANLLTL		SCRISDSYSP		QAQSRCVFLL		TLFPRRIFLE
WRTAVYNWAL		QSSHEVIRAS		CVSGFFILLQ		QQNSCNRVPK		ILIDKVKDDS
DIVKKEFASI		LGQLVCTLHG		MFYLTSSLTE		PFSEHGHVDL		FCRNLKATSQ
HECSSSQLKA		SVCKPFLFLL		KKKIPSPVKL		AFIDNLHHLC		KHLDFREDET
DVKAVLGTLL		NLMEDPDKDV		RVAFSGNIKH		ILESLDSEDG		FIKELFVLRM
KEAYTHAQIS		RNNELKDTLI		LTTGDIGRAA		KGDLVPFALL		HLLHCLLSKS
ASVSGAAYTE		IRALVAAKSV		KLQSFFSQYK		KPICQFLVES		LHSSQMTALP
NTPCQNADVR		KQDVAHQREM		ALNTLSEIAN		VFDFPDLNRF		LTRTLQVLLP
DLAAKASPAA		SALIRTLGKQ		LNVNRREILI		NNFKYIFSHL		VCSCSKDELE
RALHYLKNET		EIELGSLLRQ		DFQGLHNELL		LRIGEHYQQV		FNGLSILASF
ASSDDPYQGP		RDIISPELMA		DYLQPKLLGI		LAFFNMQLLS		SSVGIEDKKM
ALNSLMSLMK		LMGPKHVSSV		RVKMMTTLRT		GLRFKDDFPE		LCCRAWDCFV
RCLDHACLGS		LLSHVIVALL		PLIHIQPKET		AAIFHYLIIE		NRDAVQDFLH
EIYFLPDHPE		LKKIKAVLQE		YRKETSESTD		LQTTLQLSMK		AIQHENVDVR
IHALTSLKET		LYKNQEKLIK		YATDSETVEP		IISQLVTVLL		KGCQDANSQA
RLLCGECLGE		LGAIDPGRLD		FSTTETQGKD		FTFVTGVEDS		SFAYGLLMEL
TRAYLAYADN		SRAQDSAAYA		IQELLSIYDC		REMETNGPGH		QLWRRFPEHV
REILEPHLNT		RYKSSQKSTD		WSGVKKPIYL		SKLGSNFAEW		SASWAGYLIT
KVRHDLASKI		FTCCSIMMKH		DFKVTIYLLP		HILVYVLLGC		NQEDQQEVYA
EIMAVLKHDD		QHTINTQDIA		SDLCQLSTQT		VFSMLDHLTQ		WARHKFQALK
AEKCPHSKSN		RNKVDSMVST		VDYEDYQSVT		RFLDLIPQDT		LAVASFRSKA
YTRAVMHFES		FITEKKQNIQ		EHLGFLQKLY		AAMHEPDGVA		GVSAIRKAEP
SLKEQILEHE		SLGLLRDATA		CYDRAIQLEP		DQIIHYHGVV		KSMLGLGQLS
TVITQVNGVH		ANRSEWTDEL		NTYRVEAAWK		LSQWDLVENY		LAADGKSTTW
SVRLGQLLLS		AKKRDITAFY		DSLKLVRAEQ		IVPLSAASFE		RGSYQRGYEY
IVRLHMLCEL		EHSIKPLFQH		SPGDSSQEDS		LNWVARLEMT		QNSYRAKEPI
LALRRALLSL		NKRPDYNEMV		GECWLQSARV		ARKAGHHQTA		YNALLNAGES
RLAELYVERA		KWLWSKGDVH		QALIVLQKGV		ELCFPENETP		PEGKNMLIHG
RAMLLVGRFM		EETANFESNA		IMKKYKDVTA		CLPEWEDGHF		YLAKYYDKLM
PMVTDNKMEK		QGDLIRYIVL		HFGRSLQYGN		QFIYQSMPRM		LTLWLDYGTK
AYEWEKAGRS		DRVQMRNDLG		KINKVITEHT		NYLAPYQFLT		AFSQLISRIC
HSHDEVFVVL		MEIIAKVFLA		YPQQAMWMMT		AVSKSSYPMR		VNRCKEILNK
AIHMKKSLEK		FVGDATRLTD		KLLELCNKPV		DGSSSTLSMS		THFKMLKKLV
EEATFSEILI		PLQSVMIPTL		PSILGTHANH		ASHEPFPGHW		AYIAGFDDMV
EILASLQKPK		KISLKGSDGK		FYIMMCKPKD		DLRKDCRLME		FNSLINKCLR
KDAESRRREL		HIRTYAVIPL		NDECGIIEWV		NNTAGLRPIL		TKLYKEKGVY
MTGKELRQCM		LPKSAALSEK		LKVFREFLLP		RHPPIFHEWF		LRTFPDPTSW
YSSRSAYCRS		TAVMSMVGYI		LGLGDRHGEN		ILFDSLTGEC		VHVDFNCLFN
KGETFEVPEI		VPFRLTHNMV		NGMGPMGTEG		LFRRACEVTM		RLMRDQREPL
MSVLKTFLHD		PLVEWSKPVK		GHSKAPLNET		GEVVNEKAKT		HVLDIEQRLQ
GVIKTRNRVT		GLPLSIEGHV		HYLIQEATDE		NLLCQMYLGW		TPYM

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

ATR
Ідентифікатори
Символи	ATR, ATR serine/threonine kinase, FCTCS, FRP1, MEC1, SCKL, SCKL1
Зовнішні ІД	OMIM: 601215 MGI: 108028 HomoloGene: 96916 GeneCards: ATR
Реагує на сполуку
dactolisib[1]
Онтологія гена Молекулярна функція • transferase activity • DNA binding • protein kinase activity • nucleotide binding • kinase activity • MutSalpha complex binding • GO:0001948 protein binding • MutLalpha complex binding • ATP binding • protein serine/threonine kinase activity Клітинна компонента • PML body • комплекс Ґольджі • Нуклеоплазма • хромосома • клітинне ядро Біологічний процес • interstrand cross-link repair • фосфорилювання • establishment of protein-containing complex localization to telomere • replicative senescence • cellular response to UV • DNA damage checkpoint signaling • positive regulation of telomerase catalytic core complex assembly • negative regulation of DNA replication • positive regulation of telomere maintenance via telomerase • protein localization to chromosome, telomeric region • multicellular organism development • Реплікація ДНК • peptidyl-serine phosphorylation • cellular response to gamma radiation • regulation of cellular response to heat • protein autophosphorylation • positive regulation of DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator • Репарація ДНК • establishment of RNA localization to telomere • cellular response to DNA damage stimulus • telomere maintenance • regulation of signal transduction by p53 class mediator Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	545	245000
Ensembl	ENSG00000175054	ENSMUSG00000032409
UniProt	Q13535	Q9JKK8
RefSeq (мРНК)	NM_001184 NM_001354579	NM_019864
RefSeq (білок)	NP_001175 NP_001341508	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 3: 142.45 – 142.58 Mb	Хр. 9: 95.86 – 95.95 Mb
PubMed search	[2]	[3]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, cерин/треонінових протеїнкіназ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як пошкодження ДНК, репарація ДНК, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, ДНК, іоном марганцю. Локалізований у ядрі, хромосомах.

Література

• Cimprich K.A., Shin T.B., Keith C.T., Schreiber S.L. (1996). cDNA cloning and gene mapping of a candidate human cell cycle checkpoint protein.. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 93: 2850 — 2855. PubMed DOI:10.1073/pnas.93.7.2850
• Schmidt D.R., Schreiber S.L. (1999). Molecular association between ATR and two components of the nucleosome remodeling and deacetylating complex, HDAC2 and CHD4.. Biochemistry 38: 14711 — 14717. PubMed DOI:10.1021/bi991614n
• Kim S.-T., Lim D.-S., Canman C.E., Kastan M.B. (1999). Substrate specificities and identification of putative substrates of ATM kinase family members.. J. Biol. Chem. 274: 37538 — 37543. PubMed DOI:10.1074/jbc.274.53.37538
• Hall-Jackson C.A., Cross D.A.E., Morrice N., Smythe C. (1999). ATR is a caffeine-sensitive, DNA-activated protein kinase with a substrate specificity distinct from DNA-PK.. Oncogene 18: 6707 — 6713. PubMed DOI:10.1038/sj.onc.1203077
• Ward I.M., Chen J. (2001). Histone H2AX is phosphorylated in an ATR-dependent manner in response to replicational stress.. J. Biol. Chem. 276: 47759 — 47762. PubMed DOI:10.1074/jbc.C100569200
• Cortez D., Guntuku S., Qin J., Elledge S.J. (2001). ATR and ATRIP: partners in checkpoint signaling.. Science 294: 1713 — 1716. PubMed DOI:10.1126/science.1065521

Примітки

1. Сполуки, які фізично взаємодіють з ATR (ген) переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
2. Human PubMed Reference:.
3. Mouse PubMed Reference:.
4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:882 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.
5. UniProt, Q13535 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

• Хромосома 3