GABRA5

GABRA5
Ідентифікатори
Символи	GABRA5, gamma-aminobutyric acid type A receptor alpha5 subunit, EIEE79, gamma-aminobutyric acid type A receptor subunit alpha5, DEE79
Зовнішні ІД	OMIM: 137142 MGI: 95617 HomoloGene: 20219 GeneCards: GABRA5
Реагує на сполуку
	gaboxadol, isonipecotic acid, isoguvacine, Мусцимол, ZK93423, flumazenil, ZK93426, bretazenil, L-822179, methyl 6,7-dimethoxy-4-ethyl-β-carboline-3-carboxylate, Ro-15-4513, RO4938581, L-838417, ocinaplon, Алпразолам, flunitrazepam, triazolam, bicuculline, picrotoxin, CGS8216[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GABA-A receptor activity; • transporter activity; • ion channel activity; • chloride channel activity; • extracellular ligand-gated ion channel activity; • transmembrane signaling receptor activity; • signaling receptor activity; • GABA receptor binding; • inhibitory extracellular ligand-gated ion channel activity; • benzodiazepine receptor activity; • GABA-gated chloride ion channel activity; • transmitter-gated ion channel activity involved in regulation of postsynaptic membrane potential;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • cell body; • GABA-A receptor complex; • postsynaptic membrane; • мембрана; • receptor complex; • Синапс; • integral component of plasma membrane; • chloride channel complex; • neuronal cell body membrane; • Дендрит (нейробіологія); • Нуклеоплазма; • гіалоплазма; • клітинна мембрана; • Міжклітинні контакти; • GABA-ergic synapse; • integral component of postsynaptic membrane; • integral component of presynaptic membrane; • integral component of postsynaptic specialization membrane; • dendrite membrane; • neuron projection; • postsynapse;
Біологічний процес	• gamma-aminobutyric acid signaling pathway; • negative regulation of neuron apoptotic process; • cochlea development; • associative learning; • regulation of neuron apoptotic process; • neuron development; • chloride transmembrane transport; • sensory perception of sound; • ion transport; • behavioral fear response; • brain development; • inner ear receptor cell development; • chloride transport; • іннервація; • Сигнальна трансдукція; • chemical synaptic transmission; • ion transmembrane transport; • regulation of membrane potential; • nervous system process; • synaptic transmission, GABAergic; • regulation of postsynaptic membrane potential;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	2558
	110886
	ENSG00000186297
	ENSMUSG00000055078
	P31644
	Q8BHJ7
	NM_000810; NM_001165037
	NM_176942; NM_001362161; NM_001362162
	NP_000801; NP_001158509
	NP_795916; NP_001349090; NP_001349091
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

GABRA5 (англ. Gamma-aminobutyric acid type A receptor alpha5 subunit) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 462 амінокислот, а молекулярна маса — 52 146[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MDNGMFSGFI	MIKNLLLFCI	SMNLSSHFGF	SQMPTSSVKD	ETNDNITIFT
RILDGLLDGY	DNRLRPGLGE	RITQVRTDIY	VTSFGPVSDT	EMEYTIDVFF
RQSWKDERLR	FKGPMQRLPL	NNLLASKIWT	PDTFFHNGKK	SIAHNMTTPN
KLLRLEDDGT	LLYTMRLTIS	AECPMQLEDF	PMDAHACPLK	FGSYAYPNSE
VVYVWTNGST	KSVVVAEDGS	RLNQYHLMGQ	TVGTENISTS	TGEYTIMTAH
FHLKRKIGYF	VIQTYLPCIM	TVILSQVSFW	LNRESVPART	VFGVTTVLTM
TTLSISARNS	LPKVAYATAM	DWFIAVCYAF	VFSALIEFAT	VNYFTKRGWA
WDGKKALEAA	KIKKKREVIL	NKSTNAFTTG	KMSHPPNIPK	EQTPAGTSNT
TSVSVKPSEE	KTSESKKTYN	SISKIDKMSR	IVFPVLFGTF	NLVYWATYLN
REPVIKGAAS	PK

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, іонних каналів, хлорних каналів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт іонів, транспорт. Білок має сайт для зв'язування з хлоридом. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, синапсах.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Kim Y., Glatt H., Xie W., Sinnett D., Lalande M. (1997). Human gamma-aminobutyric acid-type A receptor alpha5 subunit gene (GABRA5): characterization and structural organization of the 5' flanking region.. Genomics 42: 378 — 387. PubMed DOI:10.1006/geno.1997.4770
Denis N.J., Vasilescu J., Lambert J.-P., Smith J.C., Figeys D. (2007). Tryptic digestion of ubiquitin standards reveals an improved strategy for identifying ubiquitinated proteins by mass spectrometry.. Proteomics 7: 868 — 874. PubMed DOI:10.1002/pmic.200600410

Примітки

Сполуки, які фізично взаємодіють з Gamma-aminobutyric acid type A receptor subunit alpha5 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4079 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.
UniProt, P31644 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 15

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Сполуки, які фізично взаємодіють з Gamma-aminobutyric acid type A receptor subunit alpha5 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4079 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.

[UniProt-5] UniProt, P31644 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.