LRP1

LRP1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1CR8, 1D2L, 1J8E, 2FYJ, 2FYL, 2KNX, 2KNY
Ідентифікатори
Символи	LRP1, A2MR, APOER, APR, CD91, IGFBP3R, LRP, LRP1A, TGFBR5, low density lipoprotein receptor-related protein 1, LDL receptor related protein 1, KPA, IGFBP3R1, IGFBP-3R
Зовнішні ІД	OMIM: 107770 MGI: 96828 HomoloGene: 1744 GeneCards: LRP1
Пов'язані генетичні захворювання
	Мігрень, migraine without aura, abdominal aortic aneurysm[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція	• calcium ion binding; • apolipoprotein binding; • lipoprotein particle receptor binding; • GO:0032403 protein-containing complex binding; • зв'язування з іоном металу; • protease binding; • GO:0001948 protein binding; • low-density lipoprotein particle receptor activity; • RNA binding; • amyloid-beta binding; • scavenger receptor activity; • coreceptor activity; • alpha-2 macroglobulin receptor activity; • apolipoprotein receptor activity; • clathrin heavy chain binding; • signaling receptor activity; • cargo receptor activity; • heparan sulfate proteoglycan binding;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • endocytic vesicle membrane; • Ендосома; • мембрана; • focal adhesion; • receptor complex; • клітинна мембрана; • integral component of plasma membrane; • lysosomal membrane; • neuronal cell body; • Дендрит (нейробіологія); • Ядерце; • clathrin-coated pit; • clathrin-coated vesicle; • клітинне ядро; • цитоплазма; • гіалоплазма; • early endosome; • basolateral plasma membrane; • insulin-responsive compartment; • axonal growth cone; • apical part of cell; • plasma membrane protein complex;
Біологічний процес	• lipoprotein metabolic process; • negative regulation of neuron apoptotic process; • negative regulation of platelet-derived growth factor receptor-beta signaling pathway; • negative regulation of neuron projection development; • Ендоцитоз; • regulation of actin cytoskeleton organization; • regulation of phospholipase A2 activity; • amyloid-beta clearance; • negative regulation of Wnt signaling pathway; • Старіння людини; • negative regulation of smooth muscle cell migration; • positive regulation of lipid transport; • Рецептор-опосередкований ендоцитоз; • aorta morphogenesis; • retinoid metabolic process; • regulation of cholesterol transport; • positive regulation of protein transport; • apoptotic cell clearance; • multicellular organism development; • protein kinase C-activating G protein-coupled receptor signaling pathway; • positive regulation of cholesterol efflux; • cerebral cortex development; • проліферація; • lipoprotein transport; • regulation of extracellular matrix disassembly; • astrocyte activation involved in immune response; • lipid metabolism; • Фагоцитоз; • positive regulation of cytosolic calcium ion concentration; • negative regulation of cell-substrate adhesion; • positive regulation of cell death; • positive regulation of neuron projection development; • receptor internalization; • positive regulation of protein binding; • positive regulation of insulin secretion involved in cellular response to glucose stimulus; • negative regulation of apoptotic process; • cellular lipid catabolic process; • Цитопемпсис; • positive regulation of axon extension; • positive regulation of endocytosis; • positive regulation of axon extension involved in regeneration; • positive regulation of collateral sprouting of injured axon; • positive regulation of phagocytosis; • negative regulation of cytosolic calcium ion concentration; • negative regulation of focal adhesion assembly; • negative regulation of cell death; • chemoattraction of axon; • positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade; • amyloid-beta clearance by transcytosis; • amyloid-beta clearance by cellular catabolic process; • positive regulation of Schwann cell migration; • positive regulation of amyloid-beta clearance; • positive regulation of protein localization to plasma membrane; • positive regulation of cholesterol import; • cellular response to amyloid-beta; • positive regulation of vascular associated smooth muscle cell migration; • positive regulation of lysosomal protein catabolic process; • lysosomal transport;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	4035
	16971
	ENSG00000123384
	ENSMUSG00000040249
	Q07954
	Q91ZX7
	NM_002332
	NM_008512
	NP_002323
	NP_032538
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

LRP1 (англ. LDL receptor related protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 4 544 амінокислот, а молекулярна маса — 504 606[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MLTPPLLLLL	PLLSALVAAA	IDAPKTCSPK	QFACRDQITC	ISKGWRCDGE
RDCPDGSDEA	PEICPQSKAQ	RCQPNEHNCL	GTELCVPMSR	LCNGVQDCMD
GSDEGPHCRE	LQGNCSRLGC	QHHCVPTLDG	PTCYCNSSFQ	LQADGKTCKD
FDECSVYGTC	SQLCTNTDGS	FICGCVEGYL	LQPDNRSCKA	KNEPVDRPPV
LLIANSQNIL	ATYLSGAQVS	TITPTSTRQT	TAMDFSYANE	TVCWVHVGDS
AAQTQLKCAR	MPGLKGFVDE	HTINISLSLH	HVEQMAIDWL	TGNFYFVDDI
DDRIFVCNRN	GDTCVTLLDL	ELYNPKGIAL	DPAMGKVFFT	DYGQIPKVER
CDMDGQNRTK	LVDSKIVFPH	GITLDLVSRL	VYWADAYLDY	IEVVDYEGKG
RQTIIQGILI	EHLYGLTVFE	NYLYATNSDN	ANAQQKTSVI	RVNRFNSTEY
QVVTRVDKGG	ALHIYHQRRQ	PRVRSHACEN	DQYGKPGGCS	DICLLANSHK
ARTCRCRSGF	SLGSDGKSCK	KPEHELFLVY	GKGRPGIIRG	MDMGAKVPDE
HMIPIENLMN	PRALDFHAET	GFIYFADTTS	YLIGRQKIDG	TERETILKDG
IHNVEGVAVD	WMGDNLYWTD	DGPKKTISVA	RLEKAAQTRK	TLIEGKMTHP
RAIVVDPLNG	WMYWTDWEED	PKDSRRGRLE	RAWMDGSHRD	IFVTSKTVLW
PNGLSLDIPA	GRLYWVDAFY	DRIETILLNG	TDRKIVYEGP	ELNHAFGLCH
HGNYLFWTEY	RSGSVYRLER	GVGGAPPTVT	LLRSERPPIF	EIRMYDAQQQ
QVGTNKCRVN	NGGCSSLCLA	TPGSRQCACA	EDQVLDADGV	TCLANPSYVP
PPQCQPGEFA	CANSRCIQER	WKCDGDNDCL	DNSDEAPALC	HQHTCPSDRF
KCENNRCIPN	RWLCDGDNDC	GNSEDESNAT	CSARTCPPNQ	FSCASGRCIP
ISWTCDLDDD	CGDRSDESAS	CAYPTCFPLT	QFTCNNGRCI	NINWRCDNDN
DCGDNSDEAG	CSHSCSSTQF	KCNSGRCIPE	HWTCDGDNDC	GDYSDETHAN
CTNQATRPPG	GCHTDEFQCR	LDGLCIPLRW	RCDGDTDCMD	SSDEKSCEGV
THVCDPSVKF	GCKDSARCIS	KAWVCDGDND	CEDNSDEENC	ESLACRPPSH
PCANNTSVCL	PPDKLCDGND	DCGDGSDEGE	LCDQCSLNNG	GCSHNCSVAP
GEGIVCSCPL	GMELGPDNHT	CQIQSYCAKH	LKCSQKCDQN	KFSVKCSCYE
GWVLEPDGES	CRSLDPFKPF	IIFSNRHEIR	RIDLHKGDYS	VLVPGLRNTI
ALDFHLSQSA	LYWTDVVEDK	IYRGKLLDNG	ALTSFEVVIQ	YGLATPEGLA
VDWIAGNIYW	VESNLDQIEV	AKLDGTLRTT	LLAGDIEHPR	AIALDPRDGI
LFWTDWDASL	PRIEAASMSG	AGRRTVHRET	GSGGWPNGLT	VDYLEKRILW
IDARSDAIYS	ARYDGSGHME	VLRGHEFLSH	PFAVTLYGGE	VYWTDWRTNT
LAKANKWTGH	NVTVVQRTNT	QPFDLQVYHP	SRQPMAPNPC	EANGGQGPCS
HLCLINYNRT	VSCACPHLMK	LHKDNTTCYE	FKKFLLYARQ	MEIRGVDLDA
PYYNYIISFT	VPDIDNVTVL	DYDAREQRVY	WSDVRTQAIK	RAFINGTGVE
TVVSADLPNA	HGLAVDWVSR	NLFWTSYDTN	KKQINVARLD	GSFKNAVVQG
LEQPHGLVVH	PLRGKLYWTD	GDNISMANMD	GSNRTLLFSG	QKGPVGLAID
FPESKLYWIS	SGNHTINRCN	LDGSGLEVID	AMRSQLGKAT	ALAIMGDKLW
WADQVSEKMG	TCSKADGSGS	VVLRNSTTLV	MHMKVYDESI	QLDHKGTNPC
SVNNGDCSQL	CLPTSETTRS	CMCTAGYSLR	SGQQACEGVG	SFLLYSVHEG
IRGIPLDPND	KSDALVPVSG	TSLAVGIDFH	AENDTIYWVD	MGLSTISRAK
RDQTWREDVV	TNGIGRVEGI	AVDWIAGNIY	WTDQGFDVIE	VARLNGSFRY
VVISQGLDKP	RAITVHPEKG	YLFWTEWGQY	PRIERSRLDG	TERVVLVNVS
ISWPNGISVD	YQDGKLYWCD	ARTDKIERID	LETGENREVV	LSSNNMDMFS
VSVFEDFIYW	SDRTHANGSI	KRGSKDNATD	SVPLRTGIGV	QLKDIKVFNR
DRQKGTNVCA	VANGGCQQLC	LYRGRGQRAC	ACAHGMLAED	GASCREYAGY
LLYSERTILK	SIHLSDERNL	NAPVQPFEDP	EHMKNVIALA	FDYRAGTSPG
TPNRIFFSDI	HFGNIQQIND	DGSRRITIVE	NVGSVEGLAY	HRGWDTLYWT
SYTTSTITRH	TVDQTRPGAF	ERETVITMSG	DDHPRAFVLD	ECQNLMFWTN
WNEQHPSIMR	AALSGANVLT	LIEKDIRTPN	GLAIDHRAEK	LYFSDATLDK
IERCEYDGSH	RYVILKSEPV	HPFGLAVYGE	HIFWTDWVRR	AVQRANKHVG
SNMKLLRVDI	PQQPMGIIAV	ANDTNSCELS	PCRINNGGCQ	DLCLLTHQGH
VNCSCRGGRI	LQDDLTCRAV	NSSCRAQDEF	ECANGECINF	SLTCDGVPHC
KDKSDEKPSY	CNSRRCKKTF	RQCSNGRCVS	NMLWCNGADD	CGDGSDEIPC
NKTACGVGEF	RCRDGTCIGN	SSRCNQFVDC	EDASDEMNCS	ATDCSSYFRL
GVKGVLFQPC	ERTSLCYAPS	WVCDGANDCG	DYSDERDCPG	VKRPRCPLNY
FACPSGRCIP	MSWTCDKEDD	CEHGEDETHC	NKFCSEAQFE	CQNHRCISKQ
WLCDGSDDCG	DGSDEAAHCE	GKTCGPSSFS	CPGTHVCVPE	RWLCDGDKDC
ADGADESIAA	GCLYNSTCDD	REFMCQNRQC	IPKHFVCDHD	RDCADGSDES
PECEYPTCGP	SEFRCANGRC	LSSRQWECDG	ENDCHDQSDE	APKNPHCTSQ
EHKCNASSQF	LCSSGRCVAE	ALLCNGQDDC	GDSSDERGCH	INECLSRKLS
GCSQDCEDLK	IGFKCRCRPG	FRLKDDGRTC	ADVDECSTTF	PCSQRCINTH
GSYKCLCVEG	YAPRGGDPHS	CKAVTDEEPF	LIFANRYYLR	KLNLDGSNYT
LLKQGLNNAV	ALDFDYREQM	IYWTDVTTQG	SMIRRMHLNG	SNVQVLHRTG
LSNPDGLAVD	WVGGNLYWCD	KGRDTIEVSK	LNGAYRTVLV	SSGLREPRAL
VVDVQNGYLY	WTDWGDHSLI	GRIGMDGSSR	SVIVDTKITW	PNGLTLDYVT
ERIYWADARE	DYIEFASLDG	SNRHVVLSQD	IPHIFALTLF	EDYVYWTDWE
TKSINRAHKT	TGTNKTLLIS	TLHRPMDLHV	FHALRQPDVP	NHPCKVNNGG
CSNLCLLSPG	GGHKCACPTN	FYLGSDGRTC	VSNCTASQFV	CKNDKCIPFW
WKCDTEDDCG	DHSDEPPDCP	EFKCRPGQFQ	CSTGICTNPA	FICDGDNDCQ
DNSDEANCDI	HVCLPSQFKC	TNTNRCIPGI	FRCNGQDNCG	DGEDERDCPE
VTCAPNQFQC	SITKRCIPRV	WVCDRDNDCV	DGSDEPANCT	QMTCGVDEFR
CKDSGRCIPA	RWKCDGEDDC	GDGSDEPKEE	CDERTCEPYQ	FRCKNNRCVP
GRWQCDYDND	CGDNSDEESC	TPRPCSESEF	SCANGRCIAG	RWKCDGDHDC
ADGSDEKDCT	PRCDMDQFQC	KSGHCIPLRW	RCDADADCMD	GSDEEACGTG
VRTCPLDEFQ	CNNTLCKPLA	WKCDGEDDCG	DNSDENPEEC	ARFVCPPNRP
FRCKNDRVCL	WIGRQCDGTD	NCGDGTDEED	CEPPTAHTTH	CKDKKEFLCR
NQRCLSSSLR	CNMFDDCGDG	SDEEDCSIDP	KLTSCATNAS	ICGDEARCVR
TEKAAYCACR	SGFHTVPGQP	GCQDINECLR	FGTCSQLCNN	TKGGHLCSCA
RNFMKTHNTC	KAEGSEYQVL	YIADDNEIRS	LFPGHPHSAY	EQAFQGDESV
RIDAMDVHVK	AGRVYWTNWH	TGTISYRSLP	PAAPPTTSNR	HRRQIDRGVT
HLNISGLKMP	RGIAIDWVAG	NVYWTDSGRD	VIEVAQMKGE	NRKTLISGMI
DEPHAIVVDP	LRGTMYWSDW	GNHPKIETAA	MDGTLRETLV	QDNIQWPTGL
AVDYHNERLY	WADAKLSVIG	SIRLNGTDPI	VAADSKRGLS	HPFSIDVFED
YIYGVTYINN	RVFKIHKFGH	SPLVNLTGGL	SHASDVVLYH	QHKQPEVTNP
CDRKKCEWLC	LLSPSGPVCT	CPNGKRLDNG	TCVPVPSPTP	PPDAPRPGTC
NLQCFNGGSC	FLNARRQPKC	RCQPRYTGDK	CELDQCWEHC	RNGGTCAASP
SGMPTCRCPT	GFTGPKCTQQ	VCAGYCANNS	TCTVNQGNQP	QCRCLPGFLG
DRCQYRQCSG	YCENFGTCQM	AADGSRQCRC	TAYFEGSRCE	VNKCSRCLEG
ACVVNKQSGD	VTCNCTDGRV	APSCLTCVGH	CSNGGSCTMN	SKMMPECQCP
PHMTGPRCEE	HVFSQQQPGH	IASILIPLLL	LLLLVLVAGV	VFWYKRRVQG
AKGFQHQRMT	NGAMNVEIGN	PTYKMYEGGE	PDDVGGLLDA	DFALDPDKPT
NFTNPVYATL	YMGGHGSRHS	LASTDEKREL	LGRGPEDEIG	DPLA

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, білків розвитку. Задіяний у такому біологічному процесі як ендоцитоз. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, ядрі, мембрані, клатрин-вкритих заглибинах мембрани.

Література

Van Leuven F., Stas L., Thiry E., Nelissen B., Miyake Y. (1998). Strategy to sequence the 89 exons of the human LRP1 gene coding for the lipoprotein receptor related protein: identification of one expressed mutation among 48 polymorphisms.. Genomics 52: 138 — 144. PubMed DOI:10.1006/geno.1998.5408
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
May P., Reddy Y.K., Herz J. (2002). Proteolytic processing of low density lipoprotein receptor-related protein mediates regulated release of its intracellular domain.. J. Biol. Chem. 277: 18736 — 18743. PubMed DOI:10.1074/jbc.M201979200
Kinoshita A., Shah T., Tangredi M.M., Strickland D.K., Hyman B.T. (2003). The intracellular domain of the low density lipoprotein receptor-related protein modulates transactivation mediated by amyloid precursor protein and Fe65.. J. Biol. Chem. 278: 41182 — 41188. PubMed DOI:10.1074/jbc.M306403200
May P., Herz J. (2003). LDL receptor-related proteins in neurodevelopment.. Traffic 4: 291 — 301. PubMed DOI:10.1034/j.1600-0854.2003.00086_4_5.x
Huang W., Dolmer K., Gettins P.G.W. (1999). NMR solution structure of complement-like repeat CR8 from the low density lipoprotein receptor-related protein.. J. Biol. Chem. 274: 14130 — 14136. PubMed DOI:10.1074/jbc.274.20.14130

Примітки

Захворювання, генетично пов'язані з LRP1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6692 (англ.). Процитовано 21 серпня 2017.
UniProt, Q07954 (англ.). Процитовано 21 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 12

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Захворювання, генетично пов'язані з LRP1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6692 (англ.). Процитовано 21 серпня 2017.

[UniProt-5] UniProt, Q07954 (англ.). Процитовано 21 серпня 2017.