OPTC

OPTC (англ. Opticin) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 332 амінокислот, а молекулярна маса — 37 261[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MRLLAFLSLL		ALVLQETGTA		SLPRKERKRR		EEQMPREGDS		FEVLPLRNDV
LNPDNYGEVI		DLSNYEELTD		YGDQLPEVKV		TSLAPATSIS		PAKSTTAPGT
PSSNPTMTRP		TTAGLLLSSQ		PNHGLPTCLV		CVCLGSSVYC		DDIDLEDIPP
LPRRTAYLYA		RFNRISRIRA		EDFKGLTKLK		RIDLSNNLIS		SIDNDAFRLL
HALQDLILPE		NQLEALPVLP		SGIEFLDVRL		NRLQSSGIQP		AAFRAMEKLQ
FLYLSDNLLD		SIPGPLPLSL		RSVHLQNNLI		ETMQRDVFCD		PEEHKHTRRQ
LEDIRLDGNP		INLSLFPSAY		FCLPRLPIGR		FT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

OPTC
Ідентифікатори
Символи	OPTC, OPT, opticin
Зовнішні ІД	OMIM: 605127 MGI: 2151113 HomoloGene: 8652 GeneCards: OPTC
Онтологія гена Молекулярна функція • extracellular matrix structural constituent Клітинна компонента • extracellular region • GO:0005578 Позаклітинна матриця Біологічний процес • extracellular matrix disassembly Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	26254	269120
Ensembl	ENSG00000188770	ENSMUSG00000010311
UniProt	Q9UBM4	Q920A0
RefSeq (мРНК)	NM_014359	NM_001160420 NM_001160421 NM_001160422 NM_054076 NM_001395557 NM_001395558
RefSeq (білок)	NP_055174	NP_001153892 NP_001153893 NP_001153894 NP_473417 NP_001382486 NP_001382487
Локус (UCSC)	Хр. 1: 203.49 – 203.51 Mb	Хр. 1: 133.82 – 133.84 Mb
PubMed search	[1]	[2]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Задіяний у такому біологічному процесі як поліморфізм. Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
• Friedman J.S., Ducharme R., Raymond V., Walter M.A. (2000). Isolation of a novel iris-specific and leucine-rich repeat protein (oculoglycan) using differential selection.. Invest. Ophthalmol. Vis. Sci. 41: 2059 — 2066. PubMed

Примітки

1. Human PubMed Reference:.
2. Mouse PubMed Reference:.
3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8158 (англ.). Процитовано 28 серпня 2017.
4. UniProt, Q9UBM4 (англ.). Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

• Хромосома 1