PADI6

PADI6 (англ. Peptidyl arginine deiminase 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 1-й хромосомі.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 694 амінокислот, а молекулярна маса — 77 727[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MVSVEGRAMS		FQSIIHLSLD		SPVHAVCVLG		TEICLDLSGC		APQKCQCFTI
HGSGRVLIDV		ANTVISEKED		ATIWWPLSDP		TYATVKMTSP		SPSVDADKVS
VTYYGPNEDA		PVGTAVLYLT		GIEVSLEVDI		YRNGQVEMSS		DKQAKKKWIW
GPSGWGAILL		VNCNPADVGQ		QLEDKKTKKV		IFSEEITNLS		QMTLNVQGPS
CILKKYRLVL		HTSKEESKKA		RVYWPQKDNS		STFELVLGPD		QHAYTLALLG
NHLKETFYVE		AIAFPSAEFS		GLISYSVSLV		EESQDPSIPE		TVLYKDTVVF
RVAPCVFIPC		TQVPLEVYLC		RELQLQGFVD		TVTKLSEKSN		SQVASVYEDP
NRLGRWLQDE		MAFCYTQAPH		KTTSLILDTP		QAADLDEFPM		KYSLSPGIGY
MIQDTEDHKV		ASMDSIGNLM		VSPPVKVQGK		EYPLGRVLIG		SSFYPSAEGR
AMSKTLRDFL		YAQQVQAPVE		LYSDWLMTGH		VDEFMCFIPT		DDKNEGKKGF
LLLLASPSAC		YKLFREKQKE		GYGDALLFDE		LRADQLLSNG		REAKTIDQLL
ADESLKKQNE		YVEKCIHLNR		DILKTELGLV		EQDIIEIPQL		FCLEKLTNIP
SDQQPKRSFA		RPYFPDLLRM		IVMGKNLGIP		KPFGPQIKGT		CCLEEKICCL
LEPLGFKCTF		INDFDCYLTE		VGDICACANI		RRVPFAFKWW		KMVP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

PADI6
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4DAT, 4DAU
Ідентифікатори
Символи	PADI6, hPADVI, peptidyl arginine deiminase 6, PREMBL2
Зовнішні ІД	OMIM: 610363 MGI: 2655198 HomoloGene: 17695 GeneCards: PADI6
Онтологія гена Молекулярна функція • calcium ion binding • hydrolase activity • protein-arginine deiminase activity Клітинна компонента • intermediate filament cytoskeleton • клітинне ядро • цитоплазма Біологічний процес • cellular protein localization • protein citrullination • cytoskeleton organization • cytoplasm organization • regulation of translation by machinery localization • histone citrullination Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	353238	242726
Ensembl	ENSG00000276747 ENSG00000280949	ENSMUSG00000040935
UniProt	Q6TGC4	Q8K3V4
RefSeq (мРНК)	NM_207421	NM_153106
RefSeq (білок)	NP_997304	NP_694746
Локус (UCSC)	Хр. 1: 17.37 – 17.4 Mb	Хр. 4: 140.73 – 140.74 Mb
PubMed search	[1]	[2]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, фосфопротеїнів. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Rose R., Rose M., Ottmann C. (2012). Identification and structural characterization of two 14-3-3 binding sites in the human peptidylarginine deiminase type VI.. J. Struct. Biol. 180: 65 — 72. PubMed DOI:10.1016/j.jsb.2012.05.010

Примітки

1. Human PubMed Reference:.
2. Mouse PubMed Reference:.
3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:20449 (англ.). Процитовано 18 вересня 2017.
4. UniProt, Q6TGC4 (англ.). Процитовано 18 вересня 2017.

Див. також

• Хромосома 1