PDE4B

PDE4B (англ. Phosphodiesterase 4B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 736 амінокислот, а молекулярна маса — 83 343[6].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MKKSRSVMTV		MADDNVKDYF		ECSLSKSYSS		SSNTLGIDLW		RGRRCCSGNL
QLPPLSQRQS		ERARTPEGDG		ISRPTTLPLT		TLPSIAITTV		SQECFDVENG
PSPGRSPLDP		QASSSAGLVL		HATFPGHSQR		RESFLYRSDS		DYDLSPKAMS
RNSSLPSEQH		GDDLIVTPFA		QVLASLRSVR		NNFTILTNLH		GTSNKRSPAA
SQPPVSRVNP		QEESYQKLAM		ETLEELDWCL		DQLETIQTYR		SVSEMASNKF
KRMLNRELTH		LSEMSRSGNQ		VSEYISNTFL		DKQNDVEIPS		PTQKDREKKK
KQQLMTQISG		VKKLMHSSSL		NNTSISRFGV		NTENEDHLAK		ELEDLNKWGL
NIFNVAGYSH		NRPLTCIMYA		IFQERDLLKT		FRISSDTFIT		YMMTLEDHYH
SDVAYHNSLH		AADVAQSTHV		LLSTPALDAV		FTDLEILAAI		FAAAIHDVDH
PGVSNQFLIN		TNSELALMYN		DESVLENHHL		AVGFKLLQEE		HCDIFMNLTK
KQRQTLRKMV		IDMVLATDMS		KHMSLLADLK		TMVETKKVTS		SGVLLLDNYT
DRIQVLRNMV		HCADLSNPTK		SLELYRQWTD		RIMEEFFQQG		DKERERGMEI
SPMCDKHTAS		VEKSQVGFID		YIVHPLWETW		ADLVQPDAQD		ILDTLEDNRN
WYQSMIPQSP		SPPLDEQNRD		CQGLMEKFQF		ELTLDEEDSE		GPEKEGEGHS
YFSSTKTLCV		IDPENRDSLG		ETDIDIATED		KSPVDT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

PDE4B
Наявні структури PDB Пошук для людей: PDBe RCSB Список кодів PDB 1F0J, 1RO6, 1RO9, 1ROR, 1TB5, 1XLX, 1XLZ, 1XM4, 1XM6, 1XMU, 1XMY, 1XN0, 1XOS, 1XOT, 1Y2H, 1Y2J, 2CHM, 2QYL, 3D3P, 3FRG, 3G45, 3GWT, 3HC8, 3HDZ, 3HMV, 3KKT, 3LY2, 3O0J, 3O56, 3O57, 3W5E, 3WD9, 4KP6, 4MYQ, 4NW7, 4WZI, 4X0F
Ідентифікатори
Символи	PDE4B, DPDE4, PDEIVB, phosphodiesterase 4B
Зовнішні ІД	OMIM: 600127 MGI: 99557 HomoloGene: 1953 GeneCards: PDE4B
Пов'язані генетичні захворювання
lymphoblastic leukemia[1]
Реагує на сполуку
ібуділаст, roflumilast, Роліпрам[2]
Онтологія гена Молекулярна функція • зв'язування з іоном металу • 3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase activity • hydrolase activity • cAMP binding • gamma-tubulin binding • transmembrane transporter binding • phosphoric diester hydrolase activity • 3',5'-cyclic-AMP phosphodiesterase activity • GO:0001948 protein binding Клітинна компонента • voltage-gated calcium channel complex • gamma-tubulin complex • cell periphery • гіалоплазма • GO:0097483, GO:0097481 Постсинаптичне ущільнення • dendritic spine • мембрана • центросома • Z disc • excitatory synapse • Синаптичні бульбашки Біологічний процес • regulation of high voltage-gated calcium channel activity • neutrophil homeostasis • regulation of cardiac muscle cell contraction • positive regulation of interferon-gamma production • Сигнальна трансдукція • cellular response to lipopolysaccharide • positive regulation of interleukin-2 production • leukocyte migration • negative regulation of relaxation of cardiac muscle • cellular response to epinephrine stimulus • T cell receptor signaling pathway • neutrophil chemotaxis • cAMP catabolic process • G protein-coupled receptor signaling pathway Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5142	18578
Ensembl	ENSG00000184588	ENSMUSG00000028525
UniProt	Q07343	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_001037339 NM_001037340 NM_001037341 NM_001297440 NM_001297441 NM_001297442 NM_002600	NM_001177980 NM_001177981 NM_001177982 NM_001177983 NM_019840 NM_001374780
RefSeq (білок)	NP_001032416 NP_001032417 NP_001032418 NP_001284369 NP_001284370 NP_001284371 NP_002591 NP_001032418.1 NP_002591.2	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 1: 65.79 – 66.37 Mb	Хр. 4: 102.09 – 102.61 Mb
PubMed search	[3]	[4]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Кодований геном білок за функцією належить до гідролаз. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
• McLaughlin M.M., Cieslinski L.B., Burman M., Torphy T.J., Livi G.P. (1993). A low-Km, rolipram-sensitive, cAMP-specific phosphodiesterase from human brain. Cloning and expression of cDNA, biochemical characterization of recombinant protein, and tissue distribution of mRNA.. J. Biol. Chem. 268: 6470 — 6476. PubMed

Примітки

1. Захворювання, генетично пов'язані з PDE4B переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
2. Сполуки, які фізично взаємодіють з Phosphodiesterase 4B переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
3. Human PubMed Reference:.
4. Mouse PubMed Reference:.
5. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8781 (англ.). Процитовано 25 серпня 2017.
6. UniProt, Q07343 (англ.). Процитовано 25 серпня 2017.

Див. також

• Хромосома 1