PER2

PER2 (англ. Period circadian clock 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 255 амінокислот, а молекулярна маса — 136 579[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MNGYAEFPPS		PSNPTKEPVE		PQPSQVPLQE		DVDMSSGSSG		HETNENCSTG
RDSQGSDCDD		SGKELGMLVE		PPDARQSPDT		FSLMMAKSEH		NPSTSGCSSD
QSSKVDTHKE		LIKTLKELKV		HLPADKKAKG		KASTLATLKY		ALRSVKQVKA
NEEYYQLLMS		SEGHPCGADV		PSYTVEEMES		VTSEHIVKNA		DMFAVAVSLV
SGKILYISDQ		VASIFHCKRD		AFSDAKFVEF		LAPHDVGVFH		SFTSPYKLPL
WSMCSGADSF		TQECMEEKSF		FCRVSVRKSH		ENEIRYHPFR		MTPYLVKVRD
QQGAESQLCC		LLLAERVHSG		YEAPRIPPEK		RIFTTTHTPN		CLFQDVDERA
VPLLGYLPQD		LIETPVLVQL		HPSDRPLMLA		IHKKILQSGG		QPFDYSPIRF
RARNGEYITL		DTSWSSFINP		WSRKISFIIG		RHKVRVGPLN		EDVFAAHPCT
EEKALHPSIQ		ELTEQIHRLL		LQPVPHSGSS		GYGSLGSNGS		HEHLMSQTSS
SDSNGHEDSR		RRRAEICKNG		NKTKNRSHYS		HESGEQKKKS		VTEMQTNPPA
EKKAVPAMEK		DSLGVSFPEE		LACKNQPTCS		YQQISCLDSV		IRYLESCNEA
ATLKRKCEFP		ANVPALRSSD		KRKATVSPGP		HAGEAEPPSR		VNSRTGVGTH
LTSLALPGKA		ESVASLTSQC		SYSSTIVHVG		DKKPQPELEM		VEDAASGPES
LDCLAGPALA		CGLSQEKEPF		KKLGLTKEVL		AAHTQKEEQS		FLQKFKEIRK
LSIFQSHCHY		YLQERSKGQP		SERTAPGLRN		TSGIDSPWKK		TGKNRKLKSK
RVKPRDSSES		TGSGGPVSAR		PPLVGLNATA		WSPSDTSQSS		CPAVPFPAPV
PAAYSLPVFP		APGTVAAPPA		PPHASFTVPA		VPVDLQHQFA		VQPPPFPAPL
APVMAFMLPS		YSFPSGTPNL		PQAFFPSQPQ		FPSHPTLTSE		MASASQPEFP
SRTSIPRQPC		ACPATRATPP		SAMGRASPPL		FQSRSSSPLQ		LNLLQLEEAP
EGGTGAMGTT		GATETAAVGA		DCKPGTSRDQ		QPKAPLTRDE		PSDTQNSDAL
STSSGLLNLL		LNEDLCSASG		SAASESLGSG		SLGCDASPSG		AGSSDTSHTS
KYFGSIDSSE		NNHKAKMNTG		MEESEHFIKC		VLQDPIWLLM		ADADSSVMMT
YQLPSRNLEA		VLKEDREKLK		LLQKLQPRFT		ESQKQELREV		HQWMQTGGLP
AAIDVAECVY		CENKEKGNIC		IPYEEDIPSL		GLSEVSDTKE		DENGSPLNHR
IEEQT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

PER2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3GDI, 4CT0, 4U8H
Ідентифікатори
Символи	PER2, FASPS, FASPS1, period circadian clock 2, period circadian regulator 2
Зовнішні ІД	OMIM: 603426 MGI: 1195265 HomoloGene: 7885 GeneCards: PER2
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001105 transcription coactivator activity • GO:0000975 transcription cis-regulatory region binding • GO:0001948 protein binding • transcription corepressor binding • transcription factor binding Клітинна компонента • Ядерце • perinuclear region of cytoplasm • клітинне ядро • цитоплазма Біологічний процес • histone H3 deacetylation • Глюконеогенез • regulation of transcription, DNA-templated • regulation of insulin secretion • ритмічний процес • negative regulation of fat cell proliferation • negative regulation of circadian rhythm • negative regulation of transcription by RNA polymerase II • circadian regulation of gene expression • transcription, DNA-templated • fatty acid metabolic process • regulation of cell cycle • negative regulation of protein ubiquitination • circadian regulation of translation • response to ischemia • regulation of vasoconstriction • glycogen biosynthetic process • negative regulation of transcription regulatory region DNA binding • regulation of circadian rhythm • циркадний ритм • white fat cell differentiation • regulation of glutamate uptake involved in transmission of nerve impulse • lactate biosynthetic process • negative regulation of transcription, DNA-templated • regulation of neurogenesis • positive regulation of nucleic acid-templated transcription • response to light stimulus • entrainment of circadian clock by photoperiod • positive regulation of cold-induced thermogenesis Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	8864	18627
Ensembl	ENSG00000132326	ENSMUSG00000055866
UniProt	O15055	O54943
RefSeq (мРНК)	NM_003894 NM_022817	NM_011066
RefSeq (білок)	NP_073728	NP_035196
Локус (UCSC)	Хр. 2: 238.24 – 238.29 Mb	Хр. 1: 91.34 – 91.39 Mb
PubMed search	[1]	[2]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, біологічні ритми, поліморфізм, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Shearman L.P., Zylka M.J., Weaver D.R., Kolakowski L.F. Jr., Reppert S.M. (1997). Two period homologs: circadian expression and photic regulation in the suprachiasmatic nuclei.. Neuron 19: 1261 — 1269. PubMed DOI:10.1016/S0896-6273(00)80417-1
• Eckel-Mahan K., Sassone-Corsi P. (2013). Metabolism and the circadian clock converge.. Physiol. Rev. 93: 107 — 135. PubMed DOI:10.1152/physrev.00016.2012
• Partch C.L., Green C.B., Takahashi J.S. (2014). Molecular architecture of the mammalian circadian clock.. Trends Cell Biol. 24: 90 — 99. PubMed DOI:10.1016/j.tcb.2013.07.002

Примітки

1. Human PubMed Reference:.
2. Mouse PubMed Reference:.
3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8846 (англ.). Процитовано 28 серпня 2017.
4. UniProt, O15055 (англ.). Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

• Хромосома 2