SDCBP

SDCBP (англ. Syndecan binding protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 298 амінокислот, а молекулярна маса — 32 444[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSLYPSLEDL		KVDKVIQAQT		AFSANPANPA		ILSEASAPIP		HDGNLYPRLY
PELSQYMGLS		LNEEEIRANV		AVVSGAPLQG		QLVARPSSIN		YMVAPVTGND
VGIRRAEIKQ		GIREVILCKD		QDGKIGLRLK		SIDNGIFVQL		VQANSPASLV
GLRFGDQVLQ		INGENCAGWS		SDKAHKVLKQ		AFGEKITMTI		RDRPFERTIT
MHKDSTGHVG		FIFKNGKITS		IVKDSSAARN		GLLTEHNICE		INGQNVIGLK
DSQIADILST		SGTVVTITIM		PAFIFEHIIK		RMAPSIMKSL		MDHTIPEV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

SDCBP
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1N99, 1NTE, 1OBX, 1OBY, 1OBZ, 1R6J, 1V1T, 1W9E, 1W9O, 1W9Q, 1YBO, 4Z33
Ідентифікатори
Символи	SDCBP, MDA-9, ST1, SYCL, TACIP18, MDA9, syndecan binding protein
Зовнішні ІД	OMIM: 602217 MGI: 1337026 HomoloGene: 4110 GeneCards: SDCBP
Онтологія гена Молекулярна функція • protein N-terminus binding • GO:0005110 frizzled binding • GO:0001948 protein binding • identical protein binding • cytoskeletal anchor activity • interleukin-5 receptor binding • phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate binding • lipid binding • cadherin binding • syndecan binding • protein heterodimerization activity Клітинна компонента • цитоплазма • extracellular vesicle • blood microparticle • endoplasmic reticulum membrane • мембрана • focal adhesion • Меланосома • Адгезивні контакти • клітинна мембрана • Міжклітинні контакти • Ендоплазматичний ретикулум • membrane raft • Екзосома • Цитоскелет • клітинне ядро • extracellular region • extracellular space • Нуклеоплазма • гіалоплазма • interleukin-5 receptor • Ядерна мембрана • azurophil granule lumen • внутрішньоклітинна мембранна органела Біологічний процес • positive regulation of transforming growth factor beta receptor signaling pathway • GO:0007243 intracellular signal transduction • positive regulation of extracellular exosome assembly • negative regulation of receptor internalization • protein targeting to membrane • ephrin receptor signaling pathway • substrate-dependent cell migration, cell extension • positive regulation of pathway-restricted SMAD protein phosphorylation • positive regulation of JNK cascade • positive regulation of epithelial to mesenchymal transition • regulation of mitotic cell cycle • negative regulation of proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process • positive regulation of exosomal secretion • positive regulation of phosphorylation • actin cytoskeleton organization • chemical synaptic transmission • positive regulation of cell population proliferation • positive regulation of cell growth • positive regulation of cell migration • neutrophil degranulation Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6386	53378
Ensembl	ENSG00000137575	ENSMUSG00000028249
UniProt	O00560	O08992
RefSeq (мРНК)	NM_001007067 NM_001007068 NM_001007069 NM_001007070 NM_005625 NM_001330537 NM_001348339 NM_001348340 NM_001348341	NM_001098227 NM_016807
RefSeq (білок)	NP_001007068 NP_001007069 NP_001007070 NP_001007071 NP_001317466 NP_005616 NP_001335268 NP_001335269 NP_001335270	NP_001091697 NP_058087
Локус (UCSC)	Хр. 8: 58.55 – 58.58 Mb	Хр. 4: 6.37 – 6.41 Mb
PubMed search	[1]	[2]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ліпідами. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі, мембрані, клітинних контактах, ендоплазматичному ретикулумі. Також секретований назовні.

Література

• Lin J.J., Jiang H., Fisher P.B. (1998). Melanoma differentiation associated gene-9, mda-9, is a human gamma interferon responsive gene.. Gene 207: 105 — 110. PubMed DOI:10.1016/S0378-1119(97)00562-3
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
• Fernandez-Larrea J., Merlos-Suarez A., Urena J.M., Baselga J., Arribas J. (1999). A role for a PDZ protein in the early secretory pathway for the targeting of proTGF-alpha to the cell surface.. Mol. Cell 3: 423 — 433. PubMed DOI:10.1016/S1097-2765(00)80470-0
• Grootjans J.J., Reekmans G., Ceulemans H., David G. (2000). Syntenin-syndecan binding requires syndecan-synteny and the co-operation of both PDZ domains of syntenin.. J. Biol. Chem. 275: 19933 — 19941. PubMed DOI:10.1074/jbc.M002459200
• Friand V., David G., Zimmermann P. (2015). Syntenin and syndecan in the biogenesis of exosomes.. Biol. Cell 107: 331 — 341. PubMed DOI:10.1111/boc.201500010
• Philley J.V., Kannan A., Dasgupta S. (2016). MDA-9/syntenin control.. J. Cell. Physiol. 231: 545 — 550. PubMed DOI:10.1002/jcp.25136

Примітки

1. Human PubMed Reference:.
2. Mouse PubMed Reference:.
3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10662 (англ.). Процитовано 7 вересня 2017.
4. UniProt, O00560 (англ.). Процитовано 7 вересня 2017.

Див. також

• Хромосома 8