SRBD1

SRBD1 (англ. S1 RNA binding domain 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 2-й хромосомі.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 995 амінокислот, а молекулярна маса — 111 776[5].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSSLPRRAKV		QVQDVVLKDE		FSSFSELSSA		SEEDDKEDSA		WEPQKKVPRS
RKQPPPKESK		PKRMPRVKKN		APQISDGSEV		VVVKEELNSS		VAIADTALED
RKNKLDTVQT		LKTAKTKQKC		AAQPHTVRRT		KKLKVEEETS		KASNLEGESN
SSETPSTSTV		WGGTCKKEEN		DDDFTFGQSA		LKKIKTETYP		QGQPVKFPAN
ANSTKEEVEM		NWDMVQVLSE		RTNIEPWVCA		NIIRLFNDDN		TIPFIIRYRK
ELINNLDADS		LREVQQTLEE		LRAVAKKVHS		TIQKIKKEGK		MSECLLKAML
NCKTFEELEH		VSAPYKTGSK		GTKAQRARQL		GLEGAARALL		EKPGELSLLS
YIRPDVKGLS		TLQDIEIGVQ		HILADMIAKD		KDTLDFIRNL		CQKRHVCIQS
SLAKVSSKKV		NEKDVDKFLL		YQHFSCNIRN		IHHHQILAIN		RGENLKVLTV
KVNISDGVKD		EFCRWCIQNR		WRPRSFARPE		LMKILYNSLN		DSFKRLIYPL
LCREFRAKLT		SDAEKESVMM		FGRNLRQLLL		TSPVPGRTLM		GVDPGYKHGC
KLAIISPTSQ		ILHTDVVYLH		CGQGFREAEK		IKTLLLNFNC		STVVIGNGTA
CRETEAYFAD		LIMKNYFAPL		DVVYCIVSEA		GASIYSVSPE		ANKEMPGLDP
NLRSAVSIAR		RVQDPLAELV		KIEPKHIGVG		MYQHDVSQTL		LKATLDSVVE
ECVSFVGVDI		NICSEVLLRH		IAGLNANRAK		NIIEWREKNG		PFINREQLKK
VKGLGPKSFQ		QCAGFIRINQ		DYIRTFCSQQ		TETSGQIQGV		AVTSSADVEV
TNEKQGKKKS		KTAVNVLLKP		NPLDQTCIHP		ESYDIAMRFL		SSIGGTLYEV
GKPEMQQKIN		SFLEKEGMEK		IAERLQTTVH		TLQVIIDGLS		QPESFDFRTD
FDKPDFKRSI		VCLEDLQIGT		VLTGKVENAT		LFGIFVDIGV		GKSGLIPIRN
VTEAKLSKTK		KRRSLGLGPG		ERVEVQVLNI		DIPRSRITLD		LIRVL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

SRBD1
Ідентифікатори
Символи	SRBD1, S1 RNA binding domain 1
Зовнішні ІД	MGI: 1925836 HomoloGene: 9994 GeneCards: SRBD1
Пов'язані генетичні захворювання
Глаукома[1]
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	55133	78586
Ensembl	ENSG00000068784	ENSMUSG00000024135
UniProt	Q8N5C6	Q497V5
RefSeq (мРНК)	NM_018079	NM_030133
RefSeq (білок)	NP_060549	NP_084409
Локус (UCSC)	Хр. 2: 45.39 – 45.61 Mb	Хр. 17: 85.98 – 86.15 Mb
PubMed search	[2]	[3]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
• Impens F., Radoshevich L., Cossart P., Ribet D. (2014). Mapping of SUMO sites and analysis of SUMOylation changes induced by external stimuli.. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 111: 12432 — 12437. PubMed DOI:10.1073/pnas.1413825111
• Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage.. Cell Rep. 10: 1778 — 1791. PubMed DOI:10.1016/j.celrep.2015.02.033

Примітки

1. Захворювання, генетично пов'язані з SRBD1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
2. Human PubMed Reference:.
3. Mouse PubMed Reference:.
4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:25521 (англ.). Процитовано 18 вересня 2017.
5. UniProt, Q8N5C6 (англ.). Процитовано 18 вересня 2017.

Див. також

• Хромосома 2