CNTN4

CNTN4 (англ. Contactin 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 026 амінокислот, а молекулярна маса — 113 454[5].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MRLPWELLVL		QSFILCLADD		STLHGPIFIQ		EPSPVMFPLD		SEEKKVKLNC
EVKGNPKPHI		RWKLNGTDVD		TGMDFRYSVV		EGSLLINNPN		KTQDAGTYQC
TATNSFGTIV		SREAKLQFAY		LDNFKTRTRS		TVSVRRGQGM		VLLCGPPPHS
GELSYAWIFN		EYPSYQDNRR		FVSQETGNLY		IAKVEKSDVG		NYTCVVTNTV
TNHKVLGPPT		PLILRNDGVM		GEYEPKIEVQ		FPETVPTAKG		ATVKLECFAL
GNPVPTIIWR		RADGKPIARK		ARRHKSNGIL		EIPNFQQEDA		GLYECVAENS
RGKNVARGQL		TFYAQPNWIQ		KINDIHVAME		ENVFWECKAN		GRPKPTYKWL
KNGEPLLTRD		RIQIEQGTLN		ITIVNLSDAG		MYQCLAENKH		GVIFSNAELS
VIAVGPDFSR		TLLKRVTLVK		VGGEVVIECK		PKASPKPVYT		WKKGRDILKE
NERITISEDG		NLRIINVTKS		DAGSYTCIAT		NHFGTASSTG		NLVVKDPTRV
MVPPSSMDVT		VGESIVLPCQ		VTHDHSLDIV		FTWSFNGHLI		DFDRDGDHFE
RVGGQDSAGD		LMIRNIQLKH		AGKYVCMVQT		SVDRLSAAAD		LIVRGPPGPP
EAVTIDEITD		TTAQLSWRPG		PDNHSPITMY		VIQARTPFSV		GWQAVSTVPE
LIDGKTFTAT		VVGLNPWVEY		EFRTVAANVI		GIGEPSRPSE		KRRTEEALPE
VTPANVSGGG		GSKSELVITW		ETVPEELQNG		RGFGYVVAFR		PYGKMIWMLT
VLASADASRY		VFRNESVHPF		SPFEVKVGVF		NNKGEGPFSP		TTVVYSAEEE
PTKPPASIFA		RSLSATDIEV		FWASPLEKNR		GRIQGYEVKY		WRHEDKEENA
RKIRTVGNQT		STKITNLKGS		VLYHLAVKAY		NSAGTGPSSA		TVNVTTRKPP
PSQPPGNIIW		NSSDSKIILN		WDQVKALDNE		SEVKGYKVLY		RWNRQSSTSV
IETNKTSVEL		SLPFDEDYII		EIKPFSDGGD		GSSSEQIRIP		KISNAYARGS
GASTSNACTL		SAISTIMISL		TARSSL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

CNTN4
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3JXA, 3KLD
Ідентифікатори
Символи	CNTN4, AXCAM, BIG-2, contactin 4
Зовнішні ІД	OMIM: 607280 MGI: 1095737 HomoloGene: 14257 GeneCards: CNTN4
Пов'язані генетичні захворювання
бічний аміотрофічний склероз[1]
Онтологія гена Молекулярна функція • cell-cell adhesion mediator activity Клітинна компонента • anchored component of membrane • Аксон • мембрана • extracellular region • клітинна мембрана Біологічний процес • neuron cell-cell adhesion • Адгезія клітин • axonal fasciculation • negative regulation of neuron differentiation • axonogenesis • нейробіологія розвитку • regulation of synaptic plasticity • axon guidance • brain development • neuron projection development • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • dendrite self-avoidance Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	152330	269784
Ensembl	ENSG00000144619	ENSMUSG00000064293
UniProt	Q8IWV2	Q69Z26
RefSeq (мРНК)	NM_001206955 NM_001206956 NM_175607 NM_175612 NM_175613 NM_001350095	NM_001109749 NM_001109751 NM_173004 NM_001364565 NM_001364566
RefSeq (білок)	NP_001193884 NP_001193885 NP_783200 NP_783302 NP_001337024	NP_001103219 NP_001103221 NP_766592 NP_001351494 NP_001351495
Локус (UCSC)	Хр. 3: 2.1 – 3.06 Mb	Хр. 6: 105.68 – 106.7 Mb
PubMed search	[2]	[3]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані. Також секретований назовні.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
• Bouyain S., Watkins D.J. (2010). The protein tyrosine phosphatases PTPRZ and PTPRG bind to distinct members of the contactin family of neural recognition molecules.. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 107: 2443 — 2448. PubMed DOI:10.1073/pnas.0911235107

Примітки

1. Захворювання, генетично пов'язані з CNTN4 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
2. Human PubMed Reference:.
3. Mouse PubMed Reference:.
4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2174 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.
5. UniProt, Q8IWV2 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

• Хромосома 3